自2015年起，主要由埃及伊蚊传播的寨卡病毒在巴西等美洲国家大范围扩散。7月6日，里约奥运会前夕，巴西国会参议院紧急拨款1.26亿美元抗击埃及伊蚊及其传播的登革热和寨卡病毒等。中国大陆在今年至少确诊过9例感染病例，患者都曾去过疫情发生国家和地区。

　　7月29日，在许多奥运选手和媒体入住奥运村和媒体村之后，里约奥组委也定时向村里喷放烟雾驱蚊虫预防寨卡病毒。